MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 = ATCC 700819 chromosome

Total Repeats: 35345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002163	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	218561694
2	NC_002163	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	218561694
3	NC_002163	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	218561694
4	NC_002163	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	218561694
5	NC_002163	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561694
6	NC_002163	CAA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561694
7	NC_002163	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561694
8	NC_002163	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561694
9	NC_002163	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	218561694
10	NC_002163	TCA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561694
11	NC_002163	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	218561694
12	NC_002163	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561694
13	NC_002163	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561694
14	NC_002163	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561694
15	NC_002163	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561694
16	NC_002163	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	218561694
17	NC_002163	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561694
18	NC_002163	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561694
19	NC_002163	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561694
20	NC_002163	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561694
21	NC_002163	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	218561694
22	NC_002163	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	218561694
23	NC_002163	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	218561694
24	NC_002163	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218561694
25	NC_002163	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	218561694
26	NC_002163	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	218561694
27	NC_002163	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561694
28	NC_002163	CTT	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561694
29	NC_002163	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561694
30	NC_002163	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
31	NC_002163	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
32	NC_002163	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	218561695
33	NC_002163	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561695
34	NC_002163	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561695
35	NC_002163	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	218561695
36	NC_002163	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
37	NC_002163	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218561695
38	NC_002163	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218561695
39	NC_002163	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561695
40	NC_002163	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561695
41	NC_002163	T	6	6	1764	1769	0 %	100 %	0 %	0 %	218561695
42	NC_002163	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
43	NC_002163	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
44	NC_002163	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561695
45	NC_002163	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218561695
46	NC_002163	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
47	NC_002163	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218561695
48	NC_002163	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
49	NC_002163	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	218561695
50	NC_002163	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
51	NC_002163	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	218561695
52	NC_002163	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561695
53	NC_002163	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561695
54	NC_002163	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561695
55	NC_002163	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561695
56	NC_002163	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	218561696
57	NC_002163	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561696
58	NC_002163	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561696
59	NC_002163	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	218561696
60	NC_002163	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	218561696
61	NC_002163	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561696
62	NC_002163	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	218561696
63	NC_002163	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	218561696
64	NC_002163	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	218561696
65	NC_002163	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	218561696
66	NC_002163	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218561696
67	NC_002163	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561696
68	NC_002163	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	218561696
69	NC_002163	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	218561696
70	NC_002163	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561696
71	NC_002163	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	218561696
72	NC_002163	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	218561696
73	NC_002163	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561696
74	NC_002163	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218561696
75	NC_002163	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	218561696
76	NC_002163	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	218561696
77	NC_002163	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561696
78	NC_002163	TGA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561696
79	NC_002163	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561696
80	NC_002163	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218561696
81	NC_002163	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561696
82	NC_002163	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	218561696
83	NC_002163	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	218561696
84	NC_002163	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218561696
85	NC_002163	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218561696
86	NC_002163	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561696
87	NC_002163	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561696
88	NC_002163	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	218561696
89	NC_002163	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218561696
90	NC_002163	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	218561696
91	NC_002163	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	218561696
92	NC_002163	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	218561696
93	NC_002163	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218561696
94	NC_002163	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561696
95	NC_002163	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561696
96	NC_002163	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561696
97	NC_002163	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561696
98	NC_002163	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	218561696
99	NC_002163	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561696
100	NC_002163	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218561696
101	NC_002163	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561696
102	NC_002163	TTC	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561697
103	NC_002163	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	218561697
104	NC_002163	TTC	3	9	4954	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561697
105	NC_002163	ATA	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561697
106	NC_002163	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	218561697
107	NC_002163	CATC	2	8	5057	5064	25 %	25 %	0 %	50 %	218561697
108	NC_002163	GCT	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561697
109	NC_002163	TGCA	2	8	5093	5100	25 %	25 %	25 %	25 %	218561697
110	NC_002163	AATC	2	8	5171	5178	50 %	25 %	0 %	25 %	218561697
111	NC_002163	T	7	7	5248	5254	0 %	100 %	0 %	0 %	218561697
112	NC_002163	GCAT	2	8	5287	5294	25 %	25 %	25 %	25 %	218561698
113	NC_002163	AT	3	6	5300	5305	50 %	50 %	0 %	0 %	218561698
114	NC_002163	CCT	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218561698
115	NC_002163	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561698
116	NC_002163	TTG	2	6	5391	5396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561698
117	NC_002163	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	218561698
118	NC_002163	T	6	6	5694	5699	0 %	100 %	0 %	0 %	218561698
119	NC_002163	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561698
120	NC_002163	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218561698
121	NC_002163	ACAA	2	8	5773	5780	75 %	0 %	0 %	25 %	218561698
122	NC_002163	CTC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218561698
123	NC_002163	TTC	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561698
124	NC_002163	ATA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218561698
125	NC_002163	CAT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561698
126	NC_002163	T	6	6	6119	6124	0 %	100 %	0 %	0 %	218561698
127	NC_002163	TCT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218561698
128	NC_002163	T	6	6	6145	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	218561698
129	NC_002163	TCTT	2	8	6199	6206	0 %	75 %	0 %	25 %	218561698
130	NC_002163	TGG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218561698
131	NC_002163	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218561698
132	NC_002163	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218561698
133	NC_002163	T	6	6	6337	6342	0 %	100 %	0 %	0 %	218561698
134	NC_002163	A	6	6	6392	6397	100 %	0 %	0 %	0 %	218561698
135	NC_002163	T	6	6	6452	6457	0 %	100 %	0 %	0 %	218561698
136	NC_002163	TACT	2	8	6716	6723	25 %	50 %	0 %	25 %	218561699
137	NC_002163	GTT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561699
138	NC_002163	TGA	2	6	6749	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218561699
139	NC_002163	TTTG	2	8	6761	6768	0 %	75 %	25 %	0 %	218561699
140	NC_002163	TTG	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561699
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164	NC_002163	TTTG	2	8	7784	7791	0 %	75 %	25 %	0 %	218561699
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254	NC_002163	GATT	2	8	11806	11813	25 %	50 %	25 %	0 %	218561700
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258	NC_002163	ATT	2	6	12060	12065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218561700
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261	NC_002163	ATC	2	6	12140	12145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218561700
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264	NC_002163	GTT	2	6	12350	12355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218561700
265	NC_002163	A	6	6	12515	12520	100 %	0 %	0 %	0 %	218561700
266	NC_002163	T	6	6	12524	12529	0 %	100 %	0 %	0 %	218561700
267	NC_002163	AGC	2	6	12604	12609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218561700
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